ヨハン・バプティスト・ヘンネベルク（* 1768年12月5日ウィーン生まれ、† 1822年11月27日ウィーン没）は、オーストリアの作曲家、ピアニスト、オルガニスト、そして楽長であった。
ヘンネベルクは1790年から1801年までフライハウス劇場の楽長を務め、その後1803年までアン・デア・ウィーン劇場の楽長を務めた。後にアイゼンシュタットのエステルハージ・デ・ガランタ公ニコライ2世のオルガニストに就任し、オペラの指揮も行った。1814年からはウィーン宮廷教会の聖歌隊長を務め、1818年から1822年までは帝国宮廷管弦楽団のオルガニストも務めた。
ヘンネベルクはモーツァルトのオペラ『魔笛』の制作において重要な役割を果たした。 1791年9月30日と10月1日にモーツァルトが初演を指揮した後、ヘンネベルクはその後も指揮を執りました。また、ヘンネベルク自身もいくつかのオペラを作曲し、当時大きな人気を博しました。
1797年、彼はルートヴィヒ・ヴァン・ベートーヴェンとともに、ウィーン・ホーフブルク宮殿の大レドゥーテン・ホールで1797年11月26日に上演された芸術家年金協会の仮面舞踏会のためにメヌエットとドイツ舞曲を作曲した。